什么是RT-PCR?
RT-PCR,反转录·聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)是将RNA的反转录(reverse transcription )和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。RT-PCR技术灵敏而且用途广泛,可用于检测细胞中基因表达水平,细胞中RNA病毒的含量和直接克隆特定基因的cDNA序列。
RT-PCR关键原料酶---逆转录酶
逆转录酶主要包括以下三种活性:
①逆转录活性:以RNA为模板,催化dNTP聚合,生成DNA-RNA杂合双链。
②RNase H活性:水解杂合双链中的RNA,得到与RNA互补的DNA单链(cDNA)。它是病毒生命周期中复制循坏所必需的,能限制逆转录酶的合成长度。
③DNA指导的DNA聚合酶活性:以cDNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成双链DNA。
目前通过深入研究的逆转录酶包含:
▸ 人类免疫缺陷病毒1型的逆转录(PDB:1HMV)
▸ 莫洛尼鼠白血病病毒的逆转录酶(MMLV)
▸ 禽成髓细胞瘤病毒的逆转录酶 (AMV)
▸ 维持真核细胞的染色体端粒存在的端粒酶逆转录酶
目前,分子PCR检测常用的两种逆转录酶:AMV和M-MLV。总的来说,虽然AMV的热稳定性好,对抗二级结构和高GC的能力强,但其合成cDNA的长度短,得率低,因此M-MLV是市场主流产品。目前,野生型M-MLV已可以通过基因改造弥补这些不足。
如何选择合适的逆转录酶?---国盛医学M-MLV逆转录酶
逆转录酶是由不同生化活性的不同结构酶组成,其中决定逆转录酶性能的主要取决于它的逆转录活性和RNaseH 活性,而逆转录活性又是和酶的热稳定性密切相关的。国盛医学通过基因工程技术获得了高灵敏变异的全新逆转录酶:
| 国盛M-MLV | 野生型M-MLV | AMV |
来源 | 莫洛尼鼠白血病病毒 | 莫洛尼鼠白血病病毒 | 禽成髓细胞瘤病毒 |
热稳定性 | 高,65℃ | 差,37-42℃ | 好,42-55℃ |
RNase H活性 | 完全缺失 | 弱 | 强 |
cDNA合成得率 | 高 | 较高 | 低 |
合成长度 | 长,可达10kb | 长,可达2-3kb | 短 |
对抗复杂结构RNA的能力 | 强 | 弱 | 强 |
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